Los orígenes del actual Departamento se sitúan en el año 1967, cuando el Profesor Manuel Losada Villasante se incorpora a la Universidad de Sevilla ocupando la cátedra de Química Fisiológica de una flamante Sección de Biología de la Facultad de Ciencias, en el edificio de la Fábrica de Tabacos. Con Losada se crea el Departamento de Bioquímica de la Universidad de Sevilla y Consejo Superior de Investigaciones Científicas, uno de los primeros Centros Mixtos Universidad-CSIC, distinguido tanto por la calidad de su docencia como la de su investigación, cuyos resultados ya se publicaban en las mejores revistas científicas. En 1976, el Departamento se trasladó al edificio de la Facultad de Biología en la Avenida de Reina Mercedes. La Ley Orgánica 11/1983 de Reforma Universitaria impuso una reorganización en la estructura universitaria con modificación de las funciones y composición de los Departamentos, lo que conllevó la conversión, tras un complejo proceso, en el actual Departamento de Bioquímica Vegetal y Biología Molecular (1987) con sus dos sedes en las Facultades de Química y Biología.